数据集概述
本数据集包含酿酒酵母临床菌株突变率研究的相关数据与代码文件,涉及MLH1和PMS1等位基因组合对突变率的影响分析,以及基因组和系统发育分析结果,可用于验证进化理论中关于有性生殖生物突变率调控的假设。
文件详解
- 说明文件(Document files)
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集说明,提及代码和数据文件用于复现论文分析,基因组序列数据分析相关文件存储于压缩包中,以及单倍型网络构建的输入文件信息。
- 文件名称:mutators_supp_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含菌株背景(strainBackground)、类型(type)、检测(assay)、ML值、置信区间上下限(confLower、confUpper)等突变率相关统计数据。
- 代码文件(Code files)
- 文件名称:make_figure2.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于生成论文中图表2的代码文件。
- 文件名称:mutation_rate_statistical_analysis.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于突变率统计分析的代码文件。
- 压缩包文件(Archive files)
- 文件名称:mutators_genome_analysis.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含基因组序列数据分析所需的所有数据文件和脚本。
数据来源
论文“Known mutator alleles do not markedly increase mutation rate in clinical Saccharomyces cerevisiae strains”
适用场景
- 微生物遗传学研究: 分析MLH1和PMS1等位基因组合对酿酒酵母突变率的影响机制。
- 进化理论验证: 验证有性生殖生物中突变率调控的进化理论假设。
- 临床菌株特性分析: 研究酿酒酵母临床菌株的遗传特性与突变率关系。
- 基因组数据分析方法参考: 复现论文中的基因组和系统发育分析流程。
- 微生物致病性研究: 探索突变率与酿酒酵母致病性之间的关联。