数据集概述
本数据集包含14个子数据集，记录人体原代免疫细胞中11种磷酸化蛋白质和磷脂的表达水平。数据来自不同分子干预条件下的单细胞同步测量，覆盖707至927个观测样本，可用于因果发现算法研究，提供已知因果图作为基准。
文件详解
- 实验条件数据集（共14个）
- 文件名称：cd3cd28.csv、cd3cd28icam2.csv、cd3cd28_aktinhib.csv、cd3cd28_g0076.csv、cd3cd28_psitect.csv、cd3cd28_u0126.csv、cd3cd28_ly.csv、pma.csv、b2camp.csv、cd3cd28icam2_aktinhib.csv、cd3cd28icam2_g0076.csv、cd3cd28icam2_psit.csv、cd3cd28icam2_u0126.csv、cd3cd28icam2_ly.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：每个文件对应一种刺激或抑制干预条件，包含11种磷酸化分子的定量表达数据，分子包括Raf、Erk1/Erk2、P38、Jnk、Akt、Mek1/Mek2、PKA substrates、PKC、Plcg、PIP2、PIP3
- 基准因果图文件
- 文件名称：Ground_Truth.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Sachs等人2005年通过多干预实验推导的有向因果图，作为因果发现算法的基准参考
数据来源
G. Nolan和D. Lauffenburger授权（CC BY协议）
适用场景
- 因果发现算法验证: 利用已知因果图基准，测试和比较不同因果发现算法的准确性和效率
- 细胞信号通路研究: 分析不同分子干预对11种磷酸化分子表达的影响，揭示细胞内信号传导机制
- 免疫细胞激活机制分析: 研究CD3、CD28等刺激对原代CD4+ T细胞信号网络的调控作用
- 药物靶点效果评估: 评估Akt抑制剂、MEK抑制剂等药物对细胞信号分子表达的干预效果
