SAMBA生物地理区域分支图分析数据集

数据集概述

本数据集围绕SAMBA方法展开,该方法通过结合超级树技术与区域分支图,解决生物地理研究中的多歧义问题,生成更具信息性的通用区域分支图。数据集包含方法实现所需的输入文件、分析结果及相关文档,支持全球范围内任意分类群的生物地理模式研究。

文件详解

  • 文档文件:
  • README.md:Markdown格式,包含数据集来源、作者信息及使用说明
  • 输入与分析文件:
  • scenario1_input_trees_SAMBA.tre:TRE格式,场景1的输入区域分支树文件
  • scenario1_MRP_matrix_SAMBA.nex:NEX格式,场景1的MRP矩阵文件
  • scenario1_MRP_matrix_SAMBA.ss:SS格式,场景1的MRP矩阵辅助文件
  • scenario2_input_trees_SAMBA.tre:TRE格式,场景2的输入区域分支树文件
  • scenario2_MRP_matrix_SAMBA.nex:NEX格式,场景2的MRP矩阵文件
  • scenario2_MRP_matrix_SAMBA.ss:SS格式,场景2的MRP矩阵辅助文件
  • 代码与应用文件:
  • app.R:R格式,iSAMBA网络框架的R代码文件
  • isamba.zip:ZIP格式,iSAMBA网络框架压缩包
  • 可视化文件:
  • processing.gif:GIF格式,方法处理流程动画
  • iSAMBA.png:PNG格式,iSAMBA界面截图
  • fav.png:PNG格式,网站图标文件

适用场景

  • 生物地理学研究:分析全球范围内生物类群的地理分布模式与历史
  • 系统发育分析:结合超级树技术构建通用区域分支图
  • 方法学比较:与其他生物地理分析方法(如Primary BPA、Component Analysis)进行性能对比
  • 生物多样性研究:揭示生物分布的共享模式与区域关系
  • 教学与工具开发:作为生物地理分析方法教学案例或相关工具开发的参考数据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.17 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。