数据集概述
本数据集聚焦苏格兰北乌伊斯特27个淡水湖的三刺鱼种群适应性辐射研究，整合环境、形态及基因组数据，分析表型与环境关联及遗传结构。含27种群各35尾个体的表型数据、30项环境参数及部分种群RAD测序遗传关系数据，揭示表型分化的环境与遗传驱动因素。
文件详解
- 文件名称：Genomic_PCs.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含个体ID及10个基因组主成分（genPC1至genPC10），反映种群遗传结构的主成分分析结果
- 文件名称：batch_4_fresh.plink.bim
- 文件格式：BIM
- 字段映射介绍：PLINK格式的SNP位点信息文件，记录染色体、SNP ID、遗传距离、物理位置及等位基因等
- 文件名称：depth_coordinates.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含湖泊深度及地理坐标等空间环境数据，用于表征湖泊环境的空间特征
- 文件名称：batch_4_fresh.plink.fam
- 文件格式：FAM
- 字段映射介绍：PLINK格式的样本信息文件，记录家系、个体ID、父母ID、性别及表型等样本元数据
- 文件名称：NUist_phenotypes.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含三刺鱼种群的表型数据，重点记录盔甲、脊柱等形态特征的表型变异
- 文件名称：batch_4_fresh.plink.bed
- 文件格式：BED
- 字段映射介绍：PLINK二进制格式的基因型数据文件，存储种群的RAD测序基因型信息
数据来源
论文“The ecology of an adaptive radiation of three-spined stickleback from North Uist, Scotland”
适用场景
- 进化生态学研究：分析三刺鱼种群表型分化与环境因子的关联，探究适应性辐射的生态驱动机制
- 环境基因组学分析：整合环境与基因组数据，解析遗传与环境对表型多样性的相对贡献
- 种群遗传学研究：利用RAD测序数据揭示种群遗传结构及地理距离对遗传相似性的影响
- 生态表型组学分析：研究生物因子（捕食者、竞争者）与非生物因子（离子组成、水深）对表型变异的解释力差异
