数据集概述
本数据集包含从桑蒂里亚树(Santiria apiculata)茎中分离的内生菌Paenibacillus tyrfis菌株SUK123的基因组草图数据,涵盖菌株的scaffold和contigs序列信息,为该菌株的基因组研究提供基础数据支持。
文件详解
- 文件名称: SUK123.scf2ctg.fna
- 文件格式: .fna
- 内容说明: 可能包含菌株SUK123的scaffold与contigs的核苷酸序列数据,是基因组序列的核心文件。
- 文件名称: SUK123.scaf.fna.txt
- 文件格式: .txt
- 内容说明: 包含scaffold序列的文本文件,预览内容显示以
>scaffold1开头的核苷酸序列片段,如TTCTCGATGCTGCTTCATTTTTACAAGTTTCAGTTTCGGTAATTTGATATAGCCATCAAAGAGCAAGATGTTTCCGTTGACCACGTTCGTTGTATAGGACTGCCTTGCTTTGCGACTTTTGAACTTCGGAAAATCAGCACGTCCGGAAAAGAAGTTTTGGTATGCCTTTTGCAGATGGAGTTGGGCGTT。
适用场景
- 微生物基因组学研究: 用于分析Paenibacillus tyrfis菌株SUK123的基因组结构与功能基因。
- 内生菌与宿主互作研究: 为探究该菌株与桑蒂里亚树的共生关系提供基因组数据支撑。
- 生物技术应用: 可用于挖掘该菌株潜在的生物活性基因(如抗菌、促生相关基因)。
- 微生物分类学研究: 辅助该菌株的分子鉴定与系统发育分析。