伞形科植物质体基因组非编码位点比较分析表TABLE_3

数据集概述

该数据集为伞形科五种植物(胡萝卜属、峨参属、Tiedemannia、欧芹属、海茴香属)质体基因组非编码位点的比较分析表。包含74个长度大于150bp的基因间隔区及内含子,涵盖长度、比对长度、保守位点、简约信息位点、序列分歧度等11项特征,为质体基因组进化研究提供分子数据支持。

文件详解

  • 文件名称: table.html
  • 文件格式: HTML (.html)
  • 字段映射: 表格包含11个核心字段,分别为:
  • Locus:非编码位点名称(如trnH-psbA、psbA-trnK等)
  • Length (bp):位点长度范围
  • Aligned length (bp):序列比对后的总长度
  • Constant positions:保守位点数量
  • Uninformative positions:非信息位点数量
  • Parsimony-informative positions:简约信息位点数量
  • Variable positions:可变位点数量
  • Sequence divergence (%):序列分歧度范围
  • Total indels:插入缺失总数
  • Parsimony-informative indels:简约信息插入缺失数量
  • Percent variability:序列变异百分比

适用场景

  • 植物系统发育研究:分析非编码位点变异特征,构建伞形科植物亲缘关系
  • 质体基因组进化分析:探究非编码区域长度变异、插入缺失模式及序列分歧规律
  • 分子标记开发:筛选高变异非编码位点(如trnH-psbA、rpl32-trnL)作为物种鉴定分子标记
  • 比较基因组学研究:对比不同植物类群质体非编码区域的进化速率与变异模式
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.02 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
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