数据集概述
本数据集围绕三叶虫系统发育定年方法展开,对比cal3与其他后验时间标度方法在翼头虫类三叶虫演化分析中的应用。包含定年所需输入数据、分析代码、结果文件等,为研究定年方法对宏观演化结论的影响提供支持。
文件详解
- 说明文档与配置文件:
- README.txt:TXT格式,数据集说明文档,介绍文件组成及使用方法
- all-minsampling.txt:TXT格式,全样本最小采样率数据文件
- ptero-minsampling.txt:TXT格式,翼头虫类三叶虫最小采样率数据文件
- 输入数据文件:
- PCscores-pterocephaliid.txt:TXT格式,翼头虫类三叶虫形态特征主成分得分数据
- FAD-LAD-rescaled-ptero.txt:TXT格式,翼头虫类三叶虫重新标度的首现/末现时间数据
- FAD-LAD-rescaled-all.txt:TXT格式,全样本重新标度的首现/末现时间数据
- PteroGW-pruned.tre:TRE格式,翼头虫类三叶虫简约树文件
- 分析代码与结果文件:
- trilobite_cal3_03-25-16.Rmd:RMD格式,cal3方法分析代码文件
- trilobite_workspace_03-25-2016.Rdata:RData格式,R语言分析工作空间数据
- trilobite_cal3_03-25-16.pdf:PDF格式,cal3方法分析结果报告
- figures_08-12-16.R:R格式,结果图表生成代码文件
适用场景
- 古生物学研究:翼头虫类三叶虫系统发育定年方法对比分析
- 宏观演化研究:定年方法对演化速率、分支模式等结论的影响评估
- 系统发育方法学研究:cal3与传统后验时间标度方法的性能比较
- 三叶虫演化分析:翼头虫类三叶虫形态演化速率及分支模式研究