数据集概述
本数据集包含搭建Sarcoma CellMinerCDB实例所需的协议文件,共8个文件,涵盖数据库部署配置、数据压缩包、功能模块工具等内容,涉及细胞、基因等生物信息关键词,可支持相关生物信息数据库的搭建与功能实现。
文件详解
- 描述文件
- 文件名称:moa230_description_cdb.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Category、Category_Description、Abbreviation、Definition、Df等字段,记录如Antifols类(抑制叶酸功能,阻碍DNA、RNA和蛋白质生成)等类别的描述信息
- 数据压缩包
- 文件名称:nciSarcomaData_0.0.1.tar.gz、cellminercdb-3.1.zip、geneSetPathwayAnalysis-0.99.4.tar.gz、rcellminerElasticNet-0.3.2.tar.gz、multiple_dataset_config.zip、single_dataset_config.zip、rcellminerUtilsCDB-1.4.5.tar.gz
- 文件格式:.gz(4个)、.zip(3个)
- 字段映射介绍:数据库部署所需的数据集、功能模块工具及配置文件压缩包,包含数据库核心数据、通路分析工具、弹性网络工具、数据集配置文件等内容
数据来源
论文“https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004224010034”
适用场景
- 生物信息数据库搭建:用于部署Sarcoma CellMinerCDB实例,支持相关生物信息数据的存储与管理
- 基因通路分析:利用geneSetPathwayAnalysis工具包进行基因通路相关分析研究
- 生物数据挖掘:通过rcellminerElasticNet工具开展基于弹性网络的生物数据挖掘工作
- 数据库配置优化:基于multiple_dataset_config.zip、single_dataset_config.zip等配置文件优化数据库数据集配置策略