数据集概述
本数据集包含人类miRNA与7种冠状病毒基因组的潜在相互作用预测结果,涵盖3种致病性(SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV)和4种非致病性冠状病毒,基于miRBbase v2.21的896条人类成熟miRNA序列,通过RNA22 v2工具分析生成,共3个数据文件。
文件详解
- Data Set 1(人类miRNA与冠状病毒基因组相互作用预测)
- 文件名称:Data Set 1 MiRNA and MTS distribution in HCoVs RNAs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含896条人类成熟miRNA与7种冠状病毒(3种致病性、4种非致病性)基因组的潜在结合位点预测结果,采用RNA22 v2工具及严格参数(特异性92%、敏感性22%)降低假阳性。
- Data Set 2(miRNA靶向基因预测)
- 文件名称:Data set 2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于miRDIP数据库的人类miRNA靶向基因预测结果,仅保留排名前1%的高概率靶基因,区分靶向致病性、非致病性或两类冠状病毒的miRNA。
- Data Set 3(SARS-CoV-2前体miRNA序列预测)
- 文件名称:Data Set 3.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:通过miRNAFold工具预测的SARS-CoV-2 RNA序列中可能进入人类RNAi通路的前体miRNA(pre-miRNA)序列。
数据来源
论文“Perspective: SARS-CoV-2 may regulate cellular responses through depletion of specific host miRNAs”
适用场景
- 病毒-宿主互作机制研究: 分析人类miRNA与冠状病毒基因组的潜在结合模式,探究SARS-CoV-2调控宿主细胞反应的分子机制。
- 致病性冠状病毒特性对比: 比较致病性与非致病性冠状病毒的miRNA结合位点差异,识别病毒致病性相关的分子特征。
- miRNA靶向治疗靶点筛选: 基于高置信度的miRNA-病毒结合数据,挖掘潜在的抗病毒miRNA治疗靶点。
- RNAi通路病毒调控研究: 通过SARS-CoV-2前体miRNA预测结果,研究病毒利用宿主RNAi通路的潜在机制。