数据集概述
本数据集包含Minervina、Pogorelyy等人研究中6项10x Genomics(5'GEX+abTCR+Feature barcoding)实验的CellRanger聚合输出,涉及SARS-CoV-2抗原暴露史对记忆CD8 T细胞表型和特异性的影响,支持进一步免疫机制分析。
文件详解
- 文件名称:libs_aggregate_rev.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为6项10x Genomics实验的CellRanger聚合输出数据,包含5'基因表达(GEX)、抗原受体TCR(abTCR)及Feature barcoding相关数据,具体字段需解压后结合CellRanger标准输出结构查看
数据来源
Minervina, Pogorelyy et al的medrxiv研究;原始测序数据来自SRA(编号PRJNA744851);处理脚本来自github仓库
适用场景
- 免疫表型分析: 研究SARS-CoV-2抗原暴露史对记忆CD8 T细胞表型特征的影响机制
- TCR特异性研究: 分析抗原暴露后记忆CD8 T细胞的TCR受体库特异性变化
- 基因表达关联分析: 探索5'GEX数据与T细胞表型、特异性的关联规律
- 免疫研究数据复用: 为SARS-CoV-2相关免疫记忆研究提供标准化CellRanger输出数据支持