SARS_CoV_2毒株序列变异汇总数据集

数据集概述

本数据集收集了SARS-CoV-2不同毒株(变异株)的序列变异信息,包含JSON格式的毒株变异数据文件及说明文档,为研究新冠病毒变异特征与结构映射提供支持。

文件详解

  • 毒株变异数据文件(JSON格式,共6个):
  • 具体文件:omicron.json、delta.json、omicron_BA1_BA2_diff.json、alpha.json、omicron_charge.json、mu.json
  • 字段示例(以omicron.json为例):包含"About"(基础信息)、"S"(刺突蛋白)、"PP1a"、"PP1ab"等病毒蛋白相关变异数据
  • 特殊说明:omicron_charge.json突出显示电荷变化残基;omicron_BA1_BA2_diff.json对比BA.1与BA.2毒株差异(BA.1特有变异标红、BA.2特有标蓝、共有标紫)
  • 说明文档:
  • 文件名称:CovidVariants.pdf
  • 文件格式:PDF
  • 内容:列出SARS-CoV-2蛋白及将变异映射到结构的链接

数据来源

outbreak.info、covariants.org

适用场景

  • 病毒学研究:分析不同SARS-CoV-2变异株(如奥密克戎、德尔塔)的序列变异特征
  • 结构生物学分析:将毒株变异信息映射到病毒蛋白结构,研究变异的结构影响
  • 变异株对比研究:通过omicron_BA1_BA2_diff.json等文件比较不同分支毒株的差异
  • 科研参考:借助CovidVariants.pdf文档获取病毒蛋白与结构映射的方法指引
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 7.54 MiB
最后更新 2025年12月21日
创建于 2025年12月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。