数据集概述
该数据集包含SARS-CoV-2感染的Calu-3、Caco2、Huh7和293FT细胞的未处理及已处理TMT标记蛋白质组学数据,聚焦干扰素应答的细胞类型解析定量分析,为病毒感染与免疫应答研究提供蛋白质组学数据支持。
文件详解
- 蛋白质水平数据文件:
- Calu3_Caco2_TMTpro_updatedDB_proteins.xlsx:Excel格式,包含Calu-3和Caco2细胞的蛋白质水平TMT标记定量数据
- 293FT_Huh7_TMTpro_updatedDB_proteins.xlsx:Excel格式,包含293FT和Huh7细胞的蛋白质水平TMT标记定量数据
- 肽段水平数据文件:
- Calu3_Caco2_TMTpro_updatedDB_peptides.xlsx:Excel格式,包含Calu-3和Caco2细胞的肽段水平TMT标记定量数据
- 293FT_Huh7_TMTpro_updatedDB_peptides.xlsx:Excel格式,包含293FT和Huh7细胞的肽段水平TMT标记定量数据
- 细胞归一化文件:
- Huh7_norm_file.xlsx:Excel格式,Huh7细胞的归一化数据文件
- Calu3_norm_file.xlsx:Excel格式,Calu-3细胞的归一化数据文件
- 293FT_norm_file.xlsx:Excel格式,293FT细胞的归一化数据文件
- Caco2_norm_file.xlsx:Excel格式,Caco2细胞的归一化数据文件
适用场景
- 病毒免疫学研究:分析SARS-CoV-2感染后不同细胞类型的干扰素应答蛋白质组特征
- 蛋白质组学数据分析:探究病毒感染对宿主细胞蛋白质表达的影响及调控机制
- 抗病毒免疫机制研究:挖掘干扰素介导的抗病毒应答关键蛋白质靶点
- 细胞特异性感染研究:比较不同细胞系在SARS-CoV-2感染后的蛋白质组学差异