数据集概述
本数据集聚焦美国索图斯国家森林高海拔植物群落，通过分析9个山峰群落的系统发育结构，探究海拔与系统发育随机性的关系。包含群落系统发育树、基因区域比对数据、物种分布及系统发育多样性计算相关文件，用于揭示极端环境下植物群落组装的生态进化过程。
文件详解
- TotalDataGeneRegionAlignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，包含用于系统发育分析的基因区域比对数据
- sawtooth.totalData.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：索图斯高山植物群落的系统发育树文件，记录物种间的进化关系
- speciespersummit_collect.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含物种名称（Accepted.Name.GenBank）、山峰名称（如Braxon Peak、Castle Peak等）及不同生境（Meadow）下的物种分布数据
- sawtooth.totalData.clean.concat.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：清理后的串联系统发育数据文件，用于系统发育结构分析
数据来源
论文“Increasing phylogenetic stochasticity at high elevations on summits across a remote North American wilderness”
适用场景
- 高山植物群落组装机制研究：分析海拔对系统发育随机性的影响，探究 stochastic 过程在群落构建中的作用
- 系统发育多样性分析：利用MNTD、MPD等指标，研究不同海拔植物群落的系统发育结构差异
- 物种分布与生境关联分析：结合生境类型（talus vs. meadows），分析物种系统发育相似性与生境异质性的关系
- 生态进化过程互作研究：辅助解析极端环境下植物群落系统发育模式背后的生态与进化驱动因素
