数据集概述
本数据集源自PNAS论文研究，聚焦高粱SbMATE转运蛋白的重复变异如何通过顺式与反式转录互作保护根系免受铝毒。包含双亲和全基因组关联分析（QTL-GWAS）的SNP物理位置及与铝耐受性（RNRG）、SbMATE表达（RQ）的关联P值，共2个文件，用于解析高粱抗铝胁迫的分子调控机制。
文件详解
- README文档
- 文件名称：README_for_Melo et al_2018_PNAS_QTL-GWAS.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集包含的内容，包括高粱基因组v1.4版本的SNP物理位置（pos，单位：bp）、铝耐受性（RNRG，相对净根生长）和SbMATE表达量（RQ，相对定量）的关联P值，涉及双亲作图（QTL）和全基因组关联作图（GWAS）数据。
- 压缩数据文件
- 文件名称：Melo et al_2018_PNAS_QTL-GWAS.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含QTL.csv（重组自交系数量性状定位数据）和GWAS.csv（全基因组关联分析数据），记录SNP位置、表型关联P值等信息。
数据来源
论文“Repeat variants for the SbMATE transporter protect sorghum roots from aluminum toxicity by transcriptional interplay in cis and trans”
适用场景
- 高粱抗铝胁迫分子机制研究: 分析SbMATE基因重复变异对铝耐受性的调控作用，解析顺式与反式转录互作机制。
- 作物耐逆性遗传育种: 利用QTL和GWAS数据挖掘高粱铝耐受性相关分子标记，为耐酸土壤品种选育提供靶点。
- 基因表达调控网络分析: 研究WRKY、锌指-DHHC转录因子对SbMATE启动子的结合与激活机制。
- 农业环境适应性研究: 探索酸性土壤铝毒胁迫下作物基因表达的适应性进化，提升粮食安全相关研究的数据支撑。
