数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了Schafer Lab于2012年2月22日开展的N2品系雄性成体线虫行为实验。实验在含OP50食物的NGM低蛋白琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪线虫运动,包含运动特征、原始追踪数据及标准化格式数据文件,可用于分析线虫行为模式。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:N2 male on food L_2012_02_22__11_18_1433_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动特征数据,基于tierpsy软件提取的行为特征参数
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:N2 male on food L_2012_02_22__11_18_1433.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动的原始追踪数据,记录实验过程中线虫的位置及运动状态
- 标准化格式数据文件
- 文件名称:N2 male on food L_2012_02_22__11_18_1433.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为模式分析: 研究N2品系雄性成体线虫在含食物环境中的运动轨迹、速度及行为节律
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 生物软件应用研究: 分析tierpsy软件在线虫行为追踪中的特征提取效果
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化实验数据支持