数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)N2品系的行为实验数据,记录了2010年12月14日在英国剑桥MRC分子生物学实验室Schafer团队开展的实验。实验使用tierpsy软件采集成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的运动行为,包含视频原始数据、特征提取数据等3个文件,用于线虫行为学研究。
文件详解
- 文件1:
N2 on food L_2010_12_14__12_04_38___6___3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始数据,可能记录视频帧、线虫位置追踪等基础观测信息
- 文件2:
N2 on food L_2010_12_14__12_04_38___6___3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到,对应实验中26876个分割骨架的运动特征
- 文件3:
N2 on food L_2010_12_14__12_04_38___6___3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,可能包含符合wcon格式的线虫行为数据,用于数据交换与共享
数据来源
Schafer Lab(William R Schafer团队,MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, UK)
适用场景
- 秀丽隐杆线虫行为学研究: 分析N2野生型线虫在食物环境中的运动模式、行为特征
- 模式生物行为标准化分析: 基于tierpsy软件提取的特征,建立线虫行为量化分析模型
- 实验方法学验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 生物信息学工具应用: 测试tierpsy等行为分析软件在线虫运动数据处理中的性能与效果