数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2菌株的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。实验由英国剑桥分子生物学实验室Schafer团队完成,记录了2012年10月4日成年雌雄同体N2线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为数据,包含特征数据、wcon格式数据及原始追踪数据三类文件,用于线虫行为学分析。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:N2 on food R_2012_10_04__11_01_0866_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,基于tierpsy软件追踪结果生成,包含运动轨迹、姿态等分析特征
- wcon格式数据文件
- 文件名称:N2 on food R_2012_10_04__11_01_0866.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,遵循线虫行为数据交换标准,记录行为时序信息
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:N2 on food R_2012_10_04__11_01_0866.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储tierpsy软件生成的原始追踪数据,包含26345个分段骨架数据,对应899秒实验时长、每秒约30帧的视频解析结果
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究:分析N2野生型线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为及时序变化特征
- 模式生物行为标准化分析:基于tierpsy软件输出数据,建立线虫行为量化分析的基准模型
- 神经生物学实验参考:为研究线虫神经调控机制提供行为表型数据支撑
- 生物医学实验复现:支持采用相同protocol(Yemini et al.方法)的线虫行为实验结果对比验证