Schafer_Lab_C_elegans_N2菌株2012行为实验数据集

数据集概述

本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2菌株的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。实验由英国剑桥分子生物学实验室Schafer团队完成,记录了2012年10月4日成年雌雄同体N2线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为数据,包含特征数据、wcon格式数据及原始追踪数据三类文件,用于线虫行为学分析。

文件详解

  • 特征数据文件
  • 文件名称:N2 on food R_2012_10_04__11_01_0866_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,基于tierpsy软件追踪结果生成,包含运动轨迹、姿态等分析特征
  • wcon格式数据文件
  • 文件名称:N2 on food R_2012_10_04__11_01_0866.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP(含wcon文件)
  • 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,遵循线虫行为数据交换标准,记录行为时序信息
  • 原始追踪数据文件
  • 文件名称:N2 on food R_2012_10_04__11_01_0866.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:存储tierpsy软件生成的原始追踪数据,包含26345个分段骨架数据,对应899秒实验时长、每秒约30帧的视频解析结果

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫行为学研究:分析N2野生型线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为及时序变化特征
  • 模式生物行为标准化分析:基于tierpsy软件输出数据,建立线虫行为量化分析的基准模型
  • 神经生物学实验参考:为研究线虫神经调控机制提供行为表型数据支撑
  • 生物医学实验复现:支持采用相同protocol(Yemini et al.方法)的线虫行为实验结果对比验证
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 286.16 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。