数据集概述
本数据集围绕草坪草病原菌Sclerotinia homoeocarpa的交配型(MAT)基因展开,包含4株当代菌株、4株历史模式菌株及3株Rutstroemiaceae科物种的MAT基因座测序与特征分析数据,同时涵盖1019株当代分离株的交配型多重PCR检测结果,用于研究该病原菌交配系统的进化与生物学特性。
文件详解
- 说明文档(README)
- 文件名称:README_for_FGB-14-335R2_Sh-MAT-locus_duplicated.txt、README_for_FGB-14-335R2_Sh-MAT-locus_annotation.txt、README_for_FGB-14-335R2_Sh-MAT-locus_repeat_features.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别对应MAT基因座重复特征、注释及重复序列相关的说明文档
- 压缩文件(ZIP)
- 文件名称:FGB-14-335R2_Sh-MAT-locus_repeat_features.zip、sequencing_reads.zip、FGB-14-335R2_Sh-MAT-locus_annotation.zip、FGB-14-335R2_Sh-MAT-locus_duplicated.zip、FGB-14-335R2_Sh-MAT-locus_phylogeny.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含重复特征数据、测序 reads、基因座注释、基因座重复序列及系统发育分析相关的压缩数据
- 表格文件(XLSX)
- 文件名称:Putman_MAT-Sh_FGB_Tbl-4-5_MAT-distribution-analysis.xlsx、Putman_MAT-Sh_FGB_MAT-locus-lit-search.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:分别为交配型分布分析表(含区域/局部尺度交配型频率数据)及Ascomycota门MAT基因座文献综述表
数据来源
论文“Characterization and distribution of mating-type genes of the turfgrass pathogen Sclerotinia homoeocarpa on a global scale”
适用场景
- 植物病原菌交配系统研究:分析Sclerotinia homoeocarpa交配型基因结构、分布规律及交配系统类型(异宗配合/同宗配合)
- 真菌分子进化分析:基于MAT基因座特征探究病原菌的进化关系与种群遗传结构
- 草坪病害防控策略制定:通过交配型分布数据评估病原菌有性生殖潜力,为病害流行预测提供依据
- 分子生物学实验参考:利用多重PCR检测方法及基因座注释数据,支撑相关病原菌的分子鉴定与分型研究