Sebastes_Based_岩鱼性别鉴定标记基因组特征数据

数据集概述

本数据集为Sebastes carnatus和Sebastes chrysomelas两种岩鱼的性别鉴定标记基因组特征数据,通过ddRAD-seq技术分析40个性别已知个体的基因组DNA,识别出雄性特异性位点,验证其XY性别决定系统,包含相关分析文件及验证结果。

文件详解

  • scaffCheck.R
  • 文件格式:.R
  • 字段映射介绍:R语言脚本文件,用于性别特异性位点的基因组 scaffold 检查分析
  • matches.tsv.zip
  • 文件格式:.zip(压缩TSV)
  • 字段映射介绍:压缩的制表符分隔文件,包含性别特异性位点与参考基因组的匹配信息
  • batch_7.catalog.tags.tsv.gz
  • 文件格式:.gz(压缩TSV)
  • 字段映射介绍:压缩的测序标签目录文件,记录ddRAD-seq测序数据的标签信息
  • batch_7.2.sumstats.tsv.gz
  • 文件格式:.gz(压缩TSV)
  • 字段映射介绍:压缩的统计摘要文件,包含测序数据的质量控制及位点统计信息
  • B7combined.R
  • 文件格式:.R
  • 字段映射介绍:R语言脚本文件,用于批量测序数据的整合分析

适用场景

  • 鱼类性别决定机制研究:分析Sebastes岩鱼的XY性别决定系统及Y染色体演化特征
  • 性别特异性标记开发:基于雄性特异性位点开发鱼类性别鉴定的分子标记
  • 基因组学数据分析方法验证:测试ddRAD-seq技术在性别标记识别中的应用效果
  • 生物信息学脚本复用:参考R语言脚本进行类似鱼类基因组性别分析的流程搭建
  • 水产养殖性别控制应用:为Sebastes岩鱼养殖中的性别控制提供基因组学依据
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 167.99 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。