数据集概述
本数据集为性选择基因组选择组分分析的模拟数据,基于个体模型探究该方法检测选择信号的效用。模拟二倍体有性繁殖种群,引入强配偶选择定量性状模拟性选择,通过加权FST值比较成体与后代基因组等位基因频率,分析选择位点检测效果,包含6个相关文件。
文件详解
- 代码文件
- 文件名称:chi_square.h、populations.h、life_cycle.cpp
- 文件格式:.h、.cpp
- 字段映射介绍:包含模拟实验相关的头文件和生命周期实现代码,用于支撑个体模型的运行与计算
- 数据文件
- 文件名称:12May_same-qtls_Fsts.txt、Simulation_Data.xlsx、Flanagan_and_Jones_molecol_data.docx.xlsx
- 文件格式:.txt、.xlsx
- 字段映射介绍:12May_same-qtls_Fsts.txt含多态性位点总数、成体/后代样本量等信息,及Generation、Chrom、Locus、QTL?等字段数据;Simulation_Data.xlsx为模拟数据;Flanagan_and_Jones_molecol_data.docx.xlsx为相关分子数据
数据来源
论文“Identifying signatures of sexual selection using genomewide selection components analysis”
适用场景
- 进化生物学研究:分析性选择对基因组的进化影响,探究选择信号检测方法的有效性
- 基因组选择组分分析:验证不同样本量、标记数量等条件下选择位点的检测效率
- 生物信息学方法优化:为基因组选择组分分析方法的改进提供模拟数据支撑
- 种群遗传学模拟:研究性选择下种群基因组等位基因频率的变化规律