数据集概述
本数据集为SeMRA解剖学映射数据库，支持解剖学命名资源景观分析，包含原始与处理后的映射数据、统计文件、可视化图表及配置脚本等27个文件，覆盖Uberon、MeSH等多类解剖学本体的映射关系与统计信息，可用于解剖学命名资源的整合与分析研究。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：包含数据集用途、作者信息、Zenodo下载链接及重建说明
- 配置与脚本类文件
- 文件名称：configuration.json、stats.json、Dockerfile、run_on_docker.sh、startup.sh
- 文件格式：JSON、Dockerfile、SH
- 字段映射介绍：configuration.json含项目名称、创建者、输入输出等配置项；stats.json含分布、术语计数等统计指标；Dockerfile与SH脚本用于环境部署与运行
- 数据类文件（压缩包）
- 文件名称：mapping_edges.tsv.gz、raw.sssom.tsv.gz、mapping_set_nodes.tsv.gz、raw.jsonl.gz、concept_nodes.tsv.gz、priority.sssom.tsv.gz等12个.gz文件
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：包含原始/处理后的映射边、节点数据、SSSOM格式映射文件、JSONL格式原始数据等
- 数据类文件（非压缩）
- 文件名称：raw_counts.tsv、source_summary.tsv、priority_counts.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：raw_counts.tsv为多命名资源间的映射计数矩阵；source_summary.tsv含各资源的名称、许可证、版本及术语数；priority_counts.tsv为优先级映射计数
- 可视化类文件
- 文件名称：raw_graph.svg、processed_landscape_upset.svg、processed_graph.svg、processed_landscape_histogram.svg、priority_graph.svg
- 文件格式：SVG
- 字段映射介绍：包含原始/处理后映射关系图、景观分析的Upset图与直方图、优先级映射图等可视化结果
数据来源
Zenodo（DOI: 10.5281/zenodo.11091802）
适用场景
- 解剖学命名资源整合研究：分析Uberon、MeSH等多类解剖学本体的映射关系与覆盖范围
- 生物医学本体映射质量评估：基于映射计数、优先级数据评估不同命名资源间映射的精确性与完整性
- 解剖学资源景观可视化分析：利用SVG图表展示解剖学命名资源的分布、映射关系及景观特征
- 生物医学数据标准化研究：通过SSSOM格式映射文件实现不同解剖学命名资源的标准化转换
- 生物医学数据分析环境部署：使用Dockerfile与脚本快速搭建解剖学映射数据的分析环境
