数据集概述
本数据集包含用于分析高山植物Senecio carniolicus多倍体起源模式的分子数据及分析代码，涵盖ITS序列、质体序列、AFLP矩阵等分子数据，以及用于模拟多倍体起源的R脚本和AFLP数据压缩包，支持通过AFLP数据推断多倍体是同源还是异源起源。
文件详解
- Senecio_carniolicus_ITS_sequences.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：Senecio carniolicus的ITS序列数据，包含核糖体DNA内转录间隔区的序列信息
- Senecio_carniolicus_plastid_sequences_coded.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：Senecio carniolicus的质体序列编码数据，包含质体基因组的序列信息
- InSilicoHybridisation.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于模拟多倍体起源场景的R脚本，实现基于AFLP数据推断多倍体起源模式的分析方法
- InSilicoAFLP.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：AFLP数据的压缩包，包含用于模拟多倍体起源的AFLP相关数据
- Senecio_carniolicus_AFLP_Matrix.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：Senecio carniolicus的AFLP矩阵数据，包含样本标识（Ind）及多个AFLP标记位点（如B101.5、B102.7等）的分子数据
数据来源
论文“A novel method to infer the origin of polyploids from AFLP data reveals that the Alpine polyploid complex of Senecio carniolicus (Asteraceae) evolved mainly via autopolyploidy”
适用场景
- 植物多倍体起源模式研究: 利用AFLP数据和模拟方法，分析Senecio carniolicus多倍体是同源还是异源起源
- 高山植物进化分析: 探究欧洲阿尔卑斯山Senecio carniolicus复合体的进化路径和多倍体形成机制
- 分子标记数据分析: 基于ITS序列、质体序列和AFLP矩阵，开展植物分子遗传学相关研究
- 多倍体起源模拟方法验证: 测试和应用通过Cohen's d推断多倍体起源模式的新方法
