数据集概述
本数据集通过非线性时间序列分析方法,研究土壤微生物群落在适宜(30℃)和胁迫(37℃)温度条件下的相互作用网络响应。数据包含微生物相对丰度、绝对丰度、网络结构数据及输入时间序列数据,共6个文件,涉及CSV、TXT、XLSX三种格式,可用于分析温度胁迫对微生物网络结构、正负相互作用比例及群落动态的影响。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含标题、作者信息(通讯作者Michio Kondoh等)、数据集基本背景等内容。
- smap_network_noscale_30.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:30℃适宜条件下土壤微生物网络结构数据,包含微生物属(Genera)及各属间的相互作用关系数据,列名为微生物属名称(如Achromobacter、Aciditerrimonas等)。
- smap_network_noscale_37.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:37℃胁迫条件下土壤微生物网络结构数据,字段结构与30℃文件一致,记录胁迫条件下微生物属间的相互作用关系。
- Relative_abundance_and_absolute_abundance.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:土壤微生物在不同温度条件下的相对丰度和绝对丰度数据,包含各微生物属的丰度统计信息。
- 30-UIC-input-TS.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:30℃条件下用于网络分析的输入时间序列数据,支持非线性时间序列分析的原始输入。
- 37-UIC-input-TS.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:37℃条件下用于网络分析的输入时间序列数据,字段结构与30℃文件一致。
数据来源
Tohoku University(东北大学)相关研究团队
适用场景
- 土壤微生物生态学研究: 分析温度胁迫对土壤微生物群落结构、相互作用网络及动态变化的影响。
- 微生物网络响应机制分析: 探究温度变化诱导的微生物网络重建过程,比较适宜与胁迫条件下正负相互作用比例的差异。
- 代谢与种群密度关联研究: 验证代谢速率、种群密度与微生物竞争强度的关系,解释抗SGH模式的形成机制。
- 环境胁迫生态效应评估: 评估温度胁迫对土壤微生物群落稳定性及功能的影响,为土壤生态系统管理提供数据支持。