数据集概述
本数据集记录了2020年10月至12月在法属波利尼西亚莫雷阿泻湖开展的实验数据，研究大型藻类Dictyota bartayresiana通过接触和水流介导对珊瑚Pocillopora acuta共生体微生物组和代谢组的影响，包含原始及处理后数据、分析脚本等，支持多组学关联分析。
文件详解
该数据集包含数据和脚本两大组，具体说明如下：
- 数据组（data）：分为微生物组、代谢组、多组学数据三个子文件夹
- 微生物组数据（micro）：
- 原始数据：seqtab.rds（原始ASV丰度表，RDS格式）、taxa_NS.rds（分类表，RDS格式）、sampleMetadata.csv（样本元数据，CSV格式）
- 处理后数据：ps.filt.rds（清洁 phyloseq 对象，RDS格式）、raw_asv_count.xlsx（含分类的ASV计数表，Excel格式）、vip_blast_seq.xlsx（BLAST用扩增子序列，Excel格式）、ASVsampleGroup_trmt_meanprop.xlsx（组间ASV平均相对丰度表，Excel格式）
- 分析脚本：coral_microbiome_final.Rmd（R Markdown格式）
- 代谢组数据（metab）：
- 原始数据：coralendosw_pos_fbmn.xlsx（含分子网络的FBMN数据，Excel格式）、siriusclass_coral_pos_xlsx（SIRIUS代谢物分类结果，Excel格式）、siriusform_coral_pos_xlsx（SIRIUS分子式预测结果，Excel格式）
- 处理后数据：ms1_pos_df.csv（过滤后的MS1特征峰面积表，CSV格式）、ms2_pos_df.csv（含MS2碎片谱的MS1特征峰面积表，CSV格式）、MS_sampleGroup_trmt_meanprop.xlsx（组间代谢物平均相对丰度表，Excel格式）
- 分析脚本：coral_metabolome_final.Rmd（R Markdown格式）
- 多组学数据：
- 处理后数据：endo_df_corr.xlsx（微生物组关联数据，Excel格式）、msendo_corr.xlsx（代谢组关联数据，Excel格式）
- 分析脚本：coral_multiomic_clean.Rmd（R Markdown格式）
- 水流数据：current_Papetoai_20250415-20250417_002（原始水流数据）
- 风玫瑰图脚本：script_windrose.R（R脚本格式）
- 脚本组（scripts）：
- 包含分析脚本及图表编译脚本figures.R（R脚本格式）
适用场景
- 珊瑚共生体研究：分析大型藻类竞争对珊瑚微生物组结构、代谢物组成的影响机制
- 多组学关联分析：探究珊瑚微生物组与代谢组的关联性及环境驱动因素
- 海洋生态学研究：评估水流介导的化感作用对珊瑚礁生态系统的影响
- 生物信息学方法应用：复现或扩展微生物组16S rRNA测序、非靶向代谢组学（LC-MS/MS）的分析流程
