数据集概述
本数据集围绕印度-太平洋珊瑚三角区这一海洋生物多样性热点,聚焦珊瑚物种丰富度的起源与进化问题。通过时间校准的珊瑚进化树、物种地理分布范围及模型估算的区域物种形成、灭绝和地理范围转移速率等数据,为研究该区域珊瑚多样性的形成机制提供支撑。
文件详解
- 进化树文件
- 文件名称:RSTBtree.tre、Acroporidae.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:包含时间校准的珊瑚物种进化树结构信息,记录物种间的亲缘关系及时序演化关系。
- 代码文件
- 文件名称:GeoSSE.R、patch_diversitree.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于模型估算区域物种形成、灭绝和地理范围转移速率的分析代码,支持数据处理与结果计算。
- 元数据文件
- 文件名称:Acroporidae.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:记录鹿角珊瑚科(Acroporidae)相关的元数据信息,包括物种分类、属性描述等基础数据。
- 物种数据文件
- 文件名称:Species.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含珊瑚物种的基础信息,如物种名录、地理分布范围等数据。
数据来源
论文“The origin and evolution of coral species richness in a marine biodiversity hotspot”
适用场景
- 海洋生物多样性研究:分析珊瑚三角区作为生物多样性热点的珊瑚物种丰富度形成机制。
- 物种进化分析:基于时间校准的进化树,研究珊瑚物种的起源、演化历程及时空分布规律。
- 生物地理学研究:结合物种地理分布范围数据,探讨珊瑚物种地理范围转移的驱动因素及生态影响。
- 保护生物学应用:为珊瑚礁生态系统保护策略制定提供物种多样性起源与维持机制的科学依据。