数据集概述
本数据集包含8个瑞士本地绵羊品种的基因组数据,涉及787只高密度SNP芯片(346,774个SNP)和939只中密度SNP芯片(33,828个SNP)基因型样本。通过分析群体结构、基于纯合子运行的基因组近交系数及选择信号,揭示品种间遗传多样性差异及候选基因功能,如体型、产羔数、毛色等性状相关基因。
文件详解
- 文件名称:data_2_dryad.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含瑞士本地绵羊品种的基因型数据,涵盖高密度和中密度SNP芯片的基因分型信息,支持群体结构分析、纯合子运行(ROH)计算及选择信号检测等下游分析。
数据来源
论文“Runs of homozygosity and signatures of selection: a comparison among eight local Swiss sheep breeds”
适用场景
- 绵羊群体遗传学研究: 分析瑞士本地绵羊品种的群体结构、遗传多样性及品种分化特征。
- 基因组近交系数评估: 基于纯合子运行数据量化不同密度SNP芯片对近交系数(FROH)估计的影响。
- 选择信号与候选基因挖掘: 识别与体型、产羔数、毛色等经济性状相关的选择信号及候选基因。
- 品种遗传独特性分析: 探究特定品种(如瓦莱州黑鼻羊)的私有选择信号及遗传特异性。
- 动物育种应用: 为本地适应绵羊品种的遗传改良和保种策略提供基因组学依据。