数据集概述
该数据集是关于通路网络中生物过程关系映射及疾病扰动的主研究结果，包含集合覆盖分析结果、语义距离数据、疾病/药物相关术语、癌症通路注释及网络文件等，为生物通路与疾病关联研究提供数据支持。
文件详解
- 集合覆盖相关文件：
- set cover all pathways.txt：TXT格式，记录覆盖全部基因的通路子集数据
- 语义距离文件：
- all edges.txt：TXT格式，包含通路网络中的语义距离数据，数值1表示最高语义相似度
- 疾病/药物术语文件：
- disease strings.txt：TXT格式，疾病相关过滤术语列表
- 癌症通路文件：
- all cancer pathways.txt：TXT格式，所有癌症相关通路数据
- cancer pathway nodes.txt：TXT格式，图9所用癌症样本的节点注释
- cancer GI pathways.txt：TXT格式，图10所用胃肠道癌症通路的节点注释
- cancer leukemia pathways.txt：TXT格式，图10所用白血病通路的节点注释
- 网络与功能注释文件：
- pathway network.cys：CYS格式，Cytoscape 2.7生成的通路网络文件
- edges bma wang.txt：TXT格式，生成通路网络的原始通路数据
- functionally annotated in network.txt：TXT格式，图6所用GO样本的节点注释
- pathways function.txt：TXT格式，通路功能相关数据
- 说明文件：
- READ ME results：无扩展名，数据集说明文档
适用场景
- 生物信息学研究：分析通路网络中生物过程的关联关系
- 疾病机制研究：探究疾病扰动对生物通路的影响机制
- 癌症通路分析：开展胃肠道癌症、白血病等特定癌症通路的案例研究
- 生物网络可视化：基于Cytoscape文件进行通路网络的可视化分析
- 语义相似度研究：利用语义距离数据开展通路间功能关联分析
