数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB503品系(sng-1(ok234)X基因突变体)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为实验数据,包含视频追踪原始数据及特征分析结果,用于研究该基因突变对虫体行为的影响。
文件详解
- 行为轨迹压缩文件:
- 文件名称:sng-1 (ok234)X on food R_2011_09_06__12_32_51__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的原始数据压缩包,格式遵循WCON(Worm Behavior Convention)标准
- 核心行为数据文件:
- 文件名称:sng-1 (ok234)X on food R_2011_09_06__12_32_51__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的基础追踪数据,包含26965个分段骨架信息及时间序列行为记录
- 特征分析结果文件:
- 文件名称:sng-1 (ok234)X on food R_2011_09_06__12_32_51__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含基于tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,对应视频分辨率为3.93211微米/像素,帧率30.03帧/秒,总时长898.967秒
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析sng-1基因(ok234等位突变)对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 神经行为学实验验证:验证E. Yemini等人提出的线虫行为分析方法在基因突变体研究中的应用效果
- 行为特征提取算法测试:基于tierpsy软件输出的特征数据,优化线虫行为特征提取模型
- 模式生物标准化实验参考:为线虫行为学实验提供标准化的实验设计(如30分钟适应期、OP50食物源)及数据格式参考