数据集概述
本数据集整合已发表结果与新数据,聚焦深海克拉里昂-克利珀顿区的细菌和古菌群落组成,覆盖深层海水、沉积物及多金属结核中的群落,包含15个相关文件,为研究该区域微生物空间分布提供数据支持。
文件详解
- 文档类文件:
- readme.txt:TXT格式,说明数据集文件内容
- DeepCCZ_nodule_size_and_epizoan_documentation.pdf:PDF格式,包含DeepCCZ航次采集结核的元数据(表格及照片)
- 表格数据文件:
- results_DeepCCZ_weighted_UniFrac_matrix.xlsx:XLSX格式,加权UniFrac矩阵数据
- results_DESeq2_significant_results_table_from_manuscript.xlsx:XLSX格式,DESeq2显著结果表
- DeepCCZ_sampledetails_table_from_manuscript.xlsx:XLSX格式,样本采集位置等元数据
- results_Shulse_etal_ASVs_unnorm_noeuks_etc.csv:CSV格式,未标准化的ASV数据(不含真核生物)
- results_DESeq2_nodules_east_vs_west.csv:CSV格式,结核样本东西部对比的DESeq2结果
- results_Shulse_etal_ASVs_norm_12900.csv:CSV格式,标准化至12900序列的ASV数据
- results_clone_library_taxonomies_reanalysis_Silva138.csv:CSV格式,基于Silva138的克隆文库分类重分析结果
- results_DeepCCZ_ASVs_norm_6900_nosinglets.csv:CSV格式,标准化至6900序列且无单例的ASV数据
- results_DESeq2_habitat_nodule_water.csv:CSV格式,结核与水体栖息地对比的DESeq2结果(含baseMean、log2FoldChange等字段及分类信息)
适用场景
- 深海微生物生态学研究:分析克拉里昂-克利珀顿区不同生境(海水、沉积物、结核)的微生物群落结构差异
- 微生物空间分布分析:探究该区域细菌和古菌群落的空间变化规律
- 环境因子关联研究:结合样本元数据,研究环境因素对微生物群落组成的影响
- 宏基因组数据验证:支持相关微生物多样性研究的结果复现与拓展分析