数据集概述
本数据集包含斑马鱼行为指标数据及分析可视化用R脚本,涵盖基线活动、视觉/听觉惊跳反应、习惯化等二十六项行为指标,采用非参数Bootstrap、Kruskal-Wallis检验等统计方法,支持神经活性环境化学品作用模式的识别研究。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下:
- 代码与图表目录(Code_Figures1-7/):
- 包含Fig1_R_code.csv至Fig7_R_codes.xlsx等文件,格式为.csv或.xlsx,存储生成图表的R代码
- 示例字段:加载ggplot2、corrplot等R包的代码语句,数据读取与变量定义代码
- 数据与图表目录(Data_Figures1-7/):
- 包含Fig1_data.csv至Fig7_data.xlsx等文件,格式为.csv或.xlsx,存储对应图表的原始数据
- 参考化学品云图数据目录(Reference_chemicals_data_cloud_plots/):
- 包含Processed_data_Butoxyethanol.csv等多个.csv文件,存储不同参考化学品的处理后行为数据
- ToxPi数据库与GABA细胞实验目录(ToxPi CompTox Database - GABA Cellular Assays/):
- GABA_selfmade_toxpis_top20_allchems.R等3个.R文件:GABA实验数据处理与ToxPi格式转换的R脚本
- 20231024_final_mean_GABA_AC50_matrix_per_chemical.csv:存储化学品GABA实验AC50值矩阵的.csv文件
- Read_me_cell_assay_data_to_toxpis_workflow.txt:记录细胞实验数据转ToxPi工作流程的说明文档
适用场景
- 神经毒理学研究:分析环境化学品对斑马鱼神经行为的影响及作用模式
- 化学品风险评估:通过多行为指纹识别神经活性化学品的毒性机制
- 行为数据分析方法开发:验证非参数Bootstrap、SSMD效应量等统计方法在行为学研究中的应用
- 环境污染物筛查:建立基于斑马鱼行为指标的神经活性化学品高通量筛选模型
- 数据可视化研究:探索云图、热图、多维尺度分析等在行为数据可视化中的应用