数据集概述
本数据集围绕新世界王蛇属（Lampropeltis）的深时系统发育网状结构（DTR）展开，包含生物地理学分析、系统发育树构建、祖先区域重建等相关数据与文件，支持研究该类群中的网状进化及地理起源。
文件详解
该数据集包含13个文件，具体说明如下：
- 代码文件：
- BioGEOBEARS_Tutorial_Lamps.R：R语言脚本，用于BioGeoBEARS生物地理学分析教程
- 结果文件：
- Table_S2.BioGeoBears_results.txt：文本文件，BioGeoBEARS生物地理学模型的AIC结果
- TableS1.likelihoods_lamps_hybrid.txt：文本文件，混合模型的似然值结果
- Biogeo_Lamps.txt：文本文件，生物地理学分析相关数据
- GEOREFERENCED.txt：文本文件，地理参考数据
- 系统发育与基因组数据：
- Lampropelist_NGS.zip：压缩文件，王蛇属NGS数据
- Lamp_concatenated_1.xml：XML文件，串联数据集1
- Lamp_concatenated_2.xml：XML文件，串联数据集2
- Tree1_Beast：无扩展名文件，Beast构建的系统发育树1
- Tree2_Beast：无扩展名文件，Beast构建的系统发育树2
- 图表文件：
- FigS1.Flowchart.pdf：PDF文件，研究流程图
- FigS2.Slope Stats.pdf：PDF文件，斜率统计图表
- FigS3_H2-H10.pdf：PDF文件，H2-H10模型相关图表
适用场景
- 系统发育学研究：分析王蛇属的深时网状进化模式
- 生物地理学分析：重建网状进化节点的祖先区域
- 进化生物学研究：探讨古杂交事件的地理范围与物种分化关系
- 方法学应用：测试基于 coalescent 模拟与机器学习的网状系统发育推断方法
- 爬行动物进化研究：理解蛇类及有鳞类物种形成与基因流的地理驱动因素
