数据集概述
本数据集为食蚁(蚂蚁和白蚁食性)哺乳动物肠道微生物组趋同研究的配套数据,包含15种胎盘类食蚁哺乳动物及其近缘物种的肠道微生物组信息。通过16S rRNA基因高通量测序分析,探索饮食和系统发育对肠道微生物组进化的驱动作用,验证极端食性下微生物组的趋同适应性。数据集含4个文件,支持微生物组组成及功能的关联分析。
文件详解
- 说明文档类
- 文件名称:README_for_OTU_biom_files.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:OTU biom文件的说明文档,解释OTU表的过滤标准(移除丰度低于0.000005的OTU)及数据使用方法
- 文件名称:README_for_File1_mapping_Delsuc_MueggeV2V4_Soils_n196_June17_2013.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:映射文件的说明文档,说明该文件为QIIME数据分析格式的元数据文件,可与所有biom文件配套使用
- 元数据文件
- 文件名称:File1_mapping_Delsuc_MueggeV2V4_Soils_n196_June17_2013.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含样本ID、宿主学名、宿主目、宿主科、饮食类型、食蚁属性等元数据字段,支持样本信息与微生物组数据的关联分析
- 压缩文件
- 文件名称:OTU_biom_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含过滤后的OTU表文件,用于微生物组组成及来源追踪分析
数据来源
论文“Convergence of gut microbiomes in myrmecophagous mammals”
适用场景
- 食性特化与微生物组趋同研究:分析食蚁哺乳动物肠道微生物组的趋同模式及其与极端食性的关联
- 饮食与系统发育对微生物组的驱动作用研究:验证饮食和系统发育在微生物组进化中的相对贡献
- 微生物组功能关联分析:结合OTU表与元数据,探索食蚁哺乳动物肠道微生物组的功能适应性
- 宿主-微生物共进化研究:以食蚁哺乳动物为模型,研究宿主饮食特化与肠道微生物组的协同进化机制