数据集概述
本数据集为论文“Transcriptome Analysis Provides Novel Insights into Salinity Stress Response in two Egyptian Rice Varieties with Different Tolerance Levels”的补充表格S4,记录了通过MapMan工具在水稻品种Giza 177中鉴定出的不同通路相关基因,涵盖细胞壁修饰、半纤维素合成、转录因子等8类基因通路信息,是研究水稻盐胁迫响应分子机制的重要数据支撑。
文件详解
- 文件名称:
Table S4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:表格按基因通路分类展示,包含以下类别:
- A. 细胞壁修饰(Cell wall modifications)
- B. 半纤维素合成(Hemicellulose synthesis)
- C. 纤维素合成(Cellulose synthesis)
- D. 甘露聚糖-木糖-阿拉伯糖-岩藻糖(Mannan-xylose-arabinose-fucose)
- E. 细胞壁过氧化物酶(cell wall peroxidase)
- F. MYB转录因子(TF MYB)
- G. bZIP转录因子(bZIP)
- H. 组蛋白(Histone)
数据来源
论文“Transcriptome Analysis Provides Novel Insights into Salinity Stress Response in two Egyptian Rice Varieties with Different Tolerance Levels”
适用场景
- 水稻耐盐性分子机制研究:分析Giza 177品种在盐胁迫下不同通路基因的表达模式,揭示耐盐相关分子调控网络。
- 农业生物技术应用:筛选盐胁迫响应关键基因,为水稻耐盐品种的分子育种提供靶点。
- 植物胁迫生理学研究:探究细胞壁合成、转录因子等通路在植物盐胁迫响应中的作用机制。
- 转录组数据功能注释:辅助水稻盐胁迫转录组数据的通路富集分析与功能注释。