数据集概述
该数据集围绕水生肉食亚目甲虫的系统发育展开，通过线粒体基因组数据探究其进化关系。包含基于不同分析模型（如C60+R4、LG4X+R、CAT-GTR+G）和处理方式（如AA、AA-trimmed）的系统发育树文件、序列数据及分析日志等，为甲虫进化研究提供支持。
文件详解
该数据集按分析模型和处理方式分类存储，具体说明如下：
- 根目录: Phylogeny of aquatic adephagan beetles how much can mitogenomes tell us/
- 包含C60+R4、LG4X+R、CAT-GTR+G三个核心分析模型子目录
- C60+R4模型目录（含AA和AA-trimmed子目录）:
- 输出文件示例:
- waterbeetle.phy: 系统发育分析用的序列数据文件
- waterbeetle.phy.iqtree: IQ-TREE软件生成的分析结果文件
- AA tree.pdf / AA-trimmed.pdf: 系统发育树可视化PDF文件
- waterbeetle.phy.contree: 共识树文件
- .log: 分析过程日志文件
- .ckp.gz: 检查点存档文件
- LG4X+R模型目录（含AA和AA-trimmed子目录）:
- 输出文件类型与C60+R4模型类似，包含序列数据、分析结果、系统发育树及日志等
- CAT-GTR+G模型目录（含AA、AA-trimmed、CD12、CD123子目录）:
- 输出文件示例:
- CD12 tree.pdf / AA-trimmed tree.pdf: 不同数据集的系统发育树PDF
- .treelist: 树列表文件
- .pbs: 作业提交脚本文件
- note.txt: 分析过程记录的文本文件
适用场景
- 昆虫系统发育研究: 分析水生肉食亚目甲虫的进化关系与分类地位
- 线粒体基因组应用评估: 探究线粒体基因组数据在甲虫系统发育研究中的有效性
- 进化模型比较: 对比不同分析模型（如C60+R4、CAT-GTR+G）对系统发育结果的影响
- 生物信息学方法验证: 验证IQ-TREE等软件在甲虫系统发育分析中的应用效果
