数据集概述
本数据集基于18S rRNA V9宏条形码技术，利用MiSeq双端测序技术，评估该方法在鱼类食性分析中的应用潜力。通过分析比斯开湾两种滤食性鱼类（欧洲沙丁鱼和欧洲鲱鱼）的消化DNA，验证了方法的分类分辨率和定量能力，成功区分了两种鱼类的食性差异，包括沙丁鱼的栖息地和昼夜差异。
文件详解
- 映射文件
- 文件名称：MAPPING_FILE_ALBAINAETAL2016.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：可能包含样本信息、实验设计、测序数据关联等映射信息，支持对测序数据的分析和解读。
- 过滤序列文件
- 文件名称：ALL_filtered_seqs.zip
- 文件格式：ZIP（压缩文件）
- 字段映射介绍：包含经过过滤处理的18S rRNA V9区域测序序列数据，用于后续的分类学分析和食性鉴定。
数据来源
论文“18S rRNA V9 metabarcoding for diet characterization: a critical evaluation with two sympatric zooplanktivorous fish species”
适用场景
- 鱼类食性分析: 利用宏条形码技术分析滤食性鱼类的食物组成，区分不同物种的食性差异。
- 分子食性评估方法验证: 评估18S rRNA V9宏条形码技术在处理降解/消化DNA样本中的分类分辨率和定量潜力。
- 海洋食物网研究: 结合分子数据和传统方法，深入解析海洋生态系统中的食物网结构和能量流动。
- 物种栖息地与食性关系研究: 分析鱼类食性的栖息地和昼夜差异，揭示环境因素对食性的影响。
- 宏条形码技术应用优化: 基于模拟和实际样本的评估结果，优化18S rRNA V9宏条形码在食性分析中的实验流程和数据分析方法。
