数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1083品系(egl-8(n488)V基因突变体)的行为实验记录,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的运动行为,包含视频追踪数据及特征分析结果,可用于研究egl-8基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:egl-8 (n488)V on food R_2010_05_11__12_26_19__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含秀丽隐杆线虫行为实验的原始或标准化行为数据(wcon格式)
- 核心行为数据文件
- 文件名称:egl-8 (n488)V on food R_2010_05_11__12_26_19__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心追踪数据,包含898.414秒实验时长、每秒25.7732帧的视频采样信息,以及线虫骨架分割数据(共20133个分割骨架)
- 行为特征数据文件
- 文件名称:egl-8 (n488)V on food R_2010_05_11__12_26_19__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,视频像素分辨率为每像素4.2289微米
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-8(n488)V基因突变体的行为表型,探究该基因在秀丽隐杆线虫行为调控中的作用
- 行为学实验方法验证: 基于标准化实验协议(E. Yemini et al.方法)的行为数据,可用于验证线虫行为实验方法的重复性与可靠性
- 行为特征提取算法评估: 利用已知基因型的行为数据,评估tierpsy等行为追踪软件的特征提取准确性
- 神经生物学机制研究: 结合基因信息与行为数据,探索秀丽隐杆线虫神经回路对运动行为的调控机制