数据集概述
本数据集是2022年6月4日在弗里德里希·米舍尔生物医学研究所通过Yokogawa CV7000获取的3D类器官微小测试数据,包含一个经过裁剪的视场(zyx维度50×680×535像素),覆盖两轮多重成像(R0、R1),单荧光通道为DAPI核染色,总计4个文件。
文件详解
- Readme.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集的基本背景信息,如获取时间、机构、成像参数、数据裁剪处理说明等
- R0.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:第一轮成像(R0)的3D类器官图像数据压缩包,对应经过裁剪和切片筛选的DAPI通道成像结果
- R1.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:第二轮成像(R1)的3D类器官图像数据压缩包,内容结构与R0.zip一致
- workflow-export-testdata_zenodo-1707834252021.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含
name(工作流名称)和task_list(任务列表)两个核心字段的工作流导出元数据
数据来源
弗里德里希·米舍尔生物医学研究所(Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research)
适用场景
- 3D类器官成像技术验证: 用于测试3D类器官成像分析流程的可行性与稳定性
- 生物医学成像参数优化: 基于成像分辨率、像素间距等参数,优化3D类器官荧光成像方案
- 类器官核染色分析预实验: 以DAPI核染色数据为基础,开展类器官细胞核结构分析的预实验
- 生物医学成像工作流开发: 结合JSON工作流元数据,开发或验证3D类器官成像的自动化分析流程