数据集概述
本数据集包含SIDERITE研究中用于探索化学空间中铁载体多样性的脚本和数据，主要用于生成COCONUT数据库的TMAP可视化图（补充材料图S3），支持铁载体相关的化学结构分析与聚类研究。
文件详解
- 代码文件:
- plot_COCONUT.py: Python脚本文件，运行后使用COCONUT.csv生成可交互的TMAP可视化结果（index.html和index.js）
- 数据文件:
- COCONUT.csv: CSV格式数据文件，包含铁载体ID、SMILES结构、数据库信息、铁载体分类、分子量等字段
- Tanimoto_COCONUT_SIDERITE.xlsx: Excel文件，用于聚类分析的输入数据
- Sid_structure_output3.xlsx: Excel文件，用于铁载体结构处理和统计分析的输入数据
- COCONUT4MetFrag_Canonical.xlsx: Excel文件，用于TMAP分析的输入数据
- COCONUT_r.txt: 文本文件，TMAP分析的输出数据和铁载体预测的输入数据
- COCONUT4MetFrag.xlsx: Excel文件，用于SMILES结构检查的输入数据
- 输出文件:
- index.html: HTML格式文件，TMAP可视化结果页面
- index.js: JavaScript格式文件，TMAP可视化结果的脚本文件
数据来源
RuolinHe/SIDERITE GitHub仓库
适用场景
- 铁载体化学结构分析: 探索化学空间中铁载体的结构多样性与分布特征
- 化学信息学研究: 支持基于TMAP的化学结构聚类与可视化分析
- 铁载体预测模型开发: 为铁载体预测算法提供训练和验证数据
- 天然产物化学研究: 辅助识别潜在的新型铁载体化合物
- 生物信息学分析: 结合铁载体结构数据开展生物合成途径研究
