数据集概述
本数据集为两种形态分化的Silene latifolia种群转录组资源，通过Illumina测序生成西班牙Xativa和克罗地亚Zagreb种群共4个个体的转录组数据，包含种群特异性SNP，用于QTL研究以关联表型多样性与遗传结构，共含10个文件。
文件详解
- 组装与测序文件
- 文件名称：meta_assembly.fasta.gz、CN7_1.fasta.gz、ZAG5_1.fasta.gz、CN9_1.fasta.gz、ZAG2_1.fasta.gz、silene_transcriptomes.vcf.gz
- 文件格式：.gz压缩格式
- 字段映射介绍：包含转录组组装序列、个体测序数据及种群特异性SNP数据
- 注释文件
- 文件名称：Annotation_report.xls、Annotation Summary 11-8.xlsx
- 文件格式：.xls、.xlsx
- 字段映射介绍：转录组注释报告及注释摘要数据
- 脚本文件
- 文件名称：blacklight_script.txt、analysis_scripts.txt
- 文件格式：.txt
- 字段映射介绍：包含测序分析相关脚本，如blacklight_script.txt含PBS作业调度及bowtie等工具加载命令
数据来源
Genomic Resources Notes论文“Transcriptome resources for two highly divergent Silene latifolia populations”
适用场景
- 植物种群遗传学研究: 分析两种形态分化Silene latifolia种群的遗传差异与环境适应性关联
- QTL定位研究: 利用种群特异性SNP数据开展数量性状位点定位，连接表型多样性与遗传结构
- 转录组注释分析: 通过注释文件挖掘基因功能及表达调控机制
- 植物基因组学资源补充: 丰富Silene latifolia基因组学研究资源库
