数据集概述
本数据集围绕PLOD2/琥珀酸轴调控癌症细胞上皮间质可塑性（EMT）与干性的研究展开，包含稳定同位素解析代谢组学（SIRM）分析结果及实验说明文档。数据揭示了琥珀酸积累通过降低5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）水平影响EMT相关基因转录，以及PLOD2通过调控琥珀酸促进癌症进展的机制，共包含2个文件。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：包含数据集标题、实验背景与方法概述，提及数据通过离子色谱-超高分辨傅里叶变换质谱（IC-UHR-FTMS）获取，关联PNAS论文研究内容。
- 代谢组学分析数据
- 文件名称：SIRM_HMLE_Twist_nacorrected_22Aug19_UKy_MCC_RXu_13cGlc_ICMS_cells_190928_coll_quant_plot_PNAS.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基于13C葡萄糖标记的HMLE Twist细胞SIRM分析定量结果，可能涉及代谢物丰度、同位素标记比例等与EMT过程相关的代谢组学数据。
数据来源
论文“The PLOD2/Succinate axis regulates the epithelial-mesenchymal plasticity and cancer cell stemness”
适用场景
- 癌症代谢机制研究: 分析PLOD2/琥珀酸轴对癌症细胞代谢重编程的调控作用。
- 上皮间质可塑性（EMT）机制研究: 探究琥珀酸积累对EMT相关基因转录及细胞表型的影响。
- 癌症干细胞干性调控研究: 验证琥珀酸增强癌症细胞干性的功能及分子机制。
- 表观遗传修饰分析: 研究琥珀酸介导的5hmC水平变化对癌症表观遗传调控的作用。
- 代谢组学数据应用: 利用SIRM数据开展癌症代谢标志物及治疗靶点的探索。
