数据集概述
本数据集为SIRT4调控巨噬细胞功能及伤口愈合机制研究的配套数据，核心内容是SIRT4作为赖氨酸去衣康酰化酶，通过调控巨噬细胞中蛋白质衣康酰化修饰影响免疫代谢和炎症反应的相关实验数据，包含蛋白质组学、代谢通路富集、细胞因子检测等多维度结果，共92个文件。
文件详解
- 蛋白质组学数据文件
- 文件名称：Peptides_Clean.xlsx、Protein_Summary.xlsx、Proteins_Clean.xlsx、Proteins_Long.xlsx、protein_summary_clean.csv等
- 文件格式：XLSX、CSV
- 字段映射介绍：包含清洁后的肽段和蛋白质信息、蛋白质衣康酰化修饰定量结果、蛋白质概要统计等内容
- 通路富集与统计分析文件
- 文件名称：int_lps24_unstim_enrichment.csv、ko_unstim_enrichment.csv、ko_lps24_pathway_counts.csv等
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含通路名称（pathway）、匹配基因数（hits）、预期匹配数（expected）、富集倍数（fold_enrichment）、P值（pvalue）、校正后P值（padj）等通路富集分析字段
- 实验与数据元数据文件
- 文件名称：experiment_metadata.csv、data_files_metadata.csv、figure_metadata.csv等
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含实验设计、样本处理、数据文件说明、图表对应数据等元信息
- 统计分析结果文件
- 文件名称：ranking_objects_description.csv、pc1_top_contributors.csv、pc2_top_contributors.csv、volcano_plot_metadata.csv等
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含主成分分析贡献者、火山图元数据、对象排名描述等统计分析结果
- 细胞因子检测数据文件
- 文件名称：cytokines.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含巨噬细胞中细胞因子（如IL-1β）的定量检测数据
数据来源
论文“SIRT4 Controls Macrophage Function and Wound Healing through Control of Protein Itaconylation in Mice”
适用场景
- 免疫代谢机制研究：分析SIRT4作为去衣康酰化酶在巨噬细胞代谢与炎症反应中的调控作用
- 蛋白质翻译后修饰研究：探究赖氨酸衣康酰化修饰对靶蛋白（如BCKDH复合物）功能的影响
- 炎症性疾病机制分析：研究巨噬细胞功能异常与伤口愈合延迟的关联机制
- 代谢通路富集分析：利用通路富集数据解析SIRT4缺失对巨噬细胞代谢通路的影响
- 衰老与代谢疾病研究：为理解免疫失调在衰老和代谢疾病中的作用提供数据支持
