数据集概述
本数据集包含与《Soil Biology and Biochemistry》开放获取论文相关的数据和R脚本,研究五种配对样地(农田与森林)中六种常见预处理对18O-CUE及呼吸速率、微生物生物量碳、DNA提取量、真菌/细菌/古菌丰度等参数的影响。共13个文件,涵盖数据表格与分析脚本。
文件详解
- 文档文件:
- 文件名称:info.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明各文件内容,如all_single.csv和all_single_qPCR.csv由all_data.xlsx衍生,包含所有预处理数据
- 数据文件:
- 文件名称:all_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含所有样本预处理实验的原始数据
- 文件名称:all_single.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:含180条记录,字段包括ID、样地、土地利用类型、预处理方式、重复编号、干物质质量、DNA提取量、微生物丰度等
- 文件名称:all_single_qPCR.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:含qPCR相关数据,字段包括qPCR定量的真菌/细菌/古菌丰度、DNA浓度、干物质质量等
- 文件名称:soil_characteristics.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含土壤基本特性数据
- 代码文件:
- 文件名称:treated_vs_FP_script.R、mixed_effect_model_qPCR_script.R等8个.R文件
- 文件格式:R脚本
- 字段映射介绍:用于数据分析的脚本,包括代谢数据绘图、qPCR混合效应模型分析、相对差异计算等功能
数据来源
Soil Biology and Biochemistry开放获取论文
适用场景
- 土壤微生物学研究:分析不同预处理对土壤微生物活性(如18O-CUE)的影响
- 土壤生态数据分析:利用混合效应模型研究土地利用类型与微生物特性的关系
- 实验方法优化:评估不同样本预处理方法(风干、冻干、冷冻等)对土壤微生物分析结果的影响
- 分子生态学研究:通过qPCR数据探讨土壤真菌、细菌和古菌群落丰度对预处理的响应
- 农业环境管理:为农田与森林土壤样本的标准化处理提供科学依据