数据集概述
本数据集围绕茄科植物特有的毛状体定位酰基糖生物合成通路进化展开,包含RNA测序相关的说明文档和压缩文件,记录了非模式植物中该代谢通路的基因信息、直系同源群及转录本数据,助力解析植物化学创新的分子机制,共含2个文件。
文件详解
- README_for_RNAseq_related.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明压缩包内文件内容,包括OrthoMCL鉴定的直系同源群文件(groups.txt.mod)、3种茄科植物(天仙子、龙葵、quitoense茄)的毛状体偏好表达基因表(HN_de.tab、SN_de.tab、SQ_de.tab)及对应转录本序列文件(HN_transcripts.fa、SN_transcripts.fa、SQ_transcripts.fa等)
- RNAseq_related.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,包含上述README中提及的所有基因表、转录本序列及直系同源群数据文件
数据来源
论文“Evolutionary routes to biochemical innovation revealed by integrative analysis of a plant-defense related specialized metabolic pathway”
适用场景
- 植物代谢通路进化研究: 分析茄科酰基糖生物合成通路的基因重复、分化及功能演变机制
- 植物化学创新分子机制解析: 探究植物特化代谢产物多样性的产生途径
- 非模式植物基因功能研究: 利用转录本数据及表达谱分析毛状体相关基因功能
- 植物防御代谢研究: 基于酰基糖生物合成通路数据,研究植物防御相关化合物的演化特征