数据集概述
本数据集为研究小鼠视交叉上核VIP能神经元中磷酸转运体调控昼夜转换时运动活性的原始数据，包含PiT2基因敲除（PiT2-/-）、杂合（Het）及野生型（WT）小鼠的多电极阵列（MEA）数据、不同光照条件下的运动活性数据及磷酸化蛋白质组数据，共75个文件，用于探究昼夜节律调节机制。
文件详解
- 多电极阵列（MEA）数据
- 文件名称：遵循
MEA_YYYYMMDD_基因型_编号.xlsx模式（如MEA_20220223_WT_8.xlsx、MEA_20220215_KO_6.xlsx）
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录PiT2+/+和PiT2-/-小鼠的多电极阵列实验数据，具体字段未详细说明，推测包含神经元电生理信号相关参数
- 运动活性数据
- 文件名称：遵循
光照条件_日期_编号_基因型.clklb模式（如LD_20210831_6_3144_KO.clklb、S_20211204_21_3094_fWT.clklb）
- 文件格式：.clklb
- 字段映射介绍：记录不同光照条件（LD 12:12、DD、LD 4:20、LD 20:4、DD加光脉冲）下PiT2+/+、PiT2-/-及Het小鼠的运动活性数据
- 磷酸化蛋白质组数据
- 文件名称：p29060-TMT-PhosphoAnalysisTotalProteinQuantMat.txt、p29060-TMT-PhosphoAnalysis_LongPhosphoPeptideResults_wMotif.txt、p29060-TMT-PhosphoAnalysisPhosphoResults_wStatsNMoreAnnotations_2022-07-05.txt、p29060-TMT-PhosphoAnalysisPhosphoPepQuantMat.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含磷酸化肽段分析结果，涉及modelName、Pep-Phos-Prot、contrast、diff、std.error、avgAbd、statistic、df、p.value、conf.low、conf.high、sigma、FDR、pepIDx、NumPhos、isPhos_bool、Confidence、Annotated Sequence、Modifications、ModificationForParsing、Q等字段
数据来源
论文“A phosphate transporter in VIPergic neurons of the suprachiasmatic nucleus gates locomotor activity during the light/dark transition in mice”
适用场景
- 昼夜节律调节机制研究: 分析视交叉上核VIP能神经元中磷酸转运体对小鼠昼夜转换时运动活性的调控作用
- 基因敲除小鼠表型分析: 对比PiT2+/+、PiT2-/-及Het小鼠在不同光照条件下的运动活性差异
- 神经元电生理研究: 利用多电极阵列数据探究PiT2基因对神经元电活动的影响
- 磷酸化蛋白质组学分析: 通过磷酸化蛋白质组数据研究相关信号通路的分子机制
