数据集概述
本数据集对应论文“soSMARt: In depth single molecule localization microscopy using adaptive optics and smart single objective light-sheet microscopy”中的重建结果,包含13个3D单分子超分辨率显微数据文件,覆盖COS7细胞、HepG2球状体、Jurkat细胞等样本的Lamin、TOM20、PD1等靶点的成像数据,支持超分辨率显微技术的生物学应用研究。
文件详解
- 数据文件分类
- 主要文件类型:.xlsx(7个)、.csv(6个)
- 命名规则:以论文图表标识(如Fig2-B、SI-Fig5)、样本类型(如COS7-LaminB1、HepG2_Spheroids)和成像靶点命名(如3D-Lamin、3D-TOM20)
- 字段映射(以CSV文件为例):包含id(编号)、x [nm](x坐标)、y [nm](y坐标)、z [nm](z坐标)、uncertainty [nm](不确定性)、uncertainty_y [nm](y方向不确定性)、uncertainty_z [nm](z方向不确定性)、intensity(强度)、frame(帧号)等三维定位与成像参数
- 典型文件示例:Fig2-B_3D-Lamin_COS7_WholeCell.csv(COS7细胞全细胞Lamin蛋白3D定位数据)、SI-Fig5_COS7-LaminB1.xlsx(COS7细胞LaminB1蛋白成像补充数据)
数据来源
论文“soSMARt: In depth single molecule localization microscopy using adaptive optics and smart single objective light-sheet microscopy”
适用场景
- 超分辨率显微技术性能验证: 分析自适应光学与智能单物镜光片显微技术在3D单分子定位中的精度与深度成像能力
- 细胞生物学三维结构研究: 基于Lamin、TOM20等靶点的三维坐标数据,解析细胞内蛋白质的空间分布与组织架构
- 医学成像技术优化: 结合CT相关语义关键词,探索超分辨率显微技术在医学成像领域的潜在应用
- 生物样本成像分析: 针对COS7、HepG2、Jurkat等不同细胞样本的成像数据,研究细胞类型对超分辨率成像结果的影响
- 单分子定位参数研究: 利用uncertainty、intensity等字段,分析单分子定位的不确定性、强度特征与成像质量的关联