数据集概述
本数据集包含用于历史种群遗传推断的空间显式汇总统计相关数据,涵盖新空间统计量的介绍与评估,以及通过空间显式种群动态模拟SNP数据得到的结果。这些统计量结合空间遗传算法,可捕捉遗传变异的空间分布与自相关性,用于优化种群历史模型选择与参数估计,弥补传统统计量忽略空间信息的局限。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:文档记录了使用脚本计算空间显式汇总统计量的方法,以及重现Alvarado-Serrano和Hickerson相关模拟的步骤,包含"SSS_calculation"文件夹的功能说明(含计算空间统计量的脚本)等内容。
- Simulations_results.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含基于空间显式种群动态模拟SNP数据得到的结果文件,涉及不同历史种群动态场景下空间统计量的行为特征、模型选择贡献等数据。
适用场景
- 种群遗传模型选择优化:补充传统统计量,提升复杂历史种群动态模型的区分能力。
- 空间遗传变异分析:利用空间PCA欧氏距离、遗传断裂识别等统计量,研究遗传变异的空间分布与自相关性。
- 种群历史参数估计:结合空间统计量,提高种群扩散、分化等历史参数的估计准确性。
- 进化生态学研究:为解析物种时空动态、景观模型与采样配置对遗传推断的影响提供数据支持。