数据集概述
本数据集包含枯草芽孢杆菌群体发育过程中的时空代谢组数据及配套Matlab代码,用于支持相关科学研究。数据记录了不同时间点、不同采样位置的代谢物浓度,代码用于代谢物数据的可视化分析,总计包含6个文件。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:
AminoAcidsResults.xlsx、OrganicAcidsResults.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:含代谢物浓度数据,A-F列为样本描述(样本ID、时间组、采样位置等),其余列对应各代谢物浓度(单位:µM)
- 文件名称:
nSamples.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:汇总绘图时每个均值对应的样本数量
- 代码文件
- 文件名称:
displayData.m、shadedPlot.m
- 文件格式:M
- 字段映射介绍:Matlab脚本,用于代谢物数据的可视化绘图(如时间维度的浓度变化图)
- 说明文件
- 文件名称:
ReadMe.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,含样本描述字段(ID、时间组、采样位置等)及文件使用说明
数据来源
科学文章"Simultaneous spatiotemporal transcriptomics and microscopy of Bacillus subtilis swarm development reveal cooperation across generations"
适用场景
- 微生物代谢组学研究: 分析枯草芽孢杆菌群体发育过程中代谢物的时空变化规律
- 微生物群体行为分析: 结合采样位置(径向距离)与时间点数据,探究群体扩散过程中的代谢协作机制
- 代谢数据可视化: 使用配套Matlab代码生成代谢物浓度随时间变化的可视化图表
- 微生物实验数据验证: 为枯草芽孢杆菌群体发育相关研究提供代谢组学数据支撑