数据集概述
本数据集为蜘蛛系统发育研究的锚定杂交富集(AHE)数据,包含针对蜘蛛三个分类深度的基因座和系统发育树文件:深层蜘蛛科间关系(33个类群)、捕鸟蛛科内属种关系(25个类群)及北美捕鸟蛛属种关系(83个类群)。数据集共9个文件,用于解析蜘蛛系统发育树的深层与浅层进化关系,支持分类学研究及宏观进化假说验证。
文件详解
- 基因座压缩文件(Loci zip files)
- 文件名称:Euctenizidae_loci.zip、Aphonopelma_loci.zip、Araneae_loci.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:分别对应捕鸟蛛科(Euctenizidae)、北美捕鸟蛛属(Aphonopelma)及整个蜘蛛目(Araneae)的目标基因座数据,包含用于系统发育分析的核苷酸序列信息。
- 系统发育树压缩文件(Trees zip files)
- 文件名称:Euctenizidae_trees.zip、Aphonopelma_trees.zip、Araneae_trees.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:对应上述三个分类深度的系统发育树结果文件,包含基于基因座数据构建的进化关系拓扑结构及支持度信息。
- 分类单元文本文件(Taxon text files)
- 文件名称:Euctenizidae.txt、Aphonopelma.txt、Araneae.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含各研究类群的编号及分类学信息(如Euctenizidae.txt含MY编号、科属种名称,示例:I6720_MY_2485_Euctenizidae_Apomastus_sp)。
数据来源
论文“Expanding anchored hybrid enrichment to resolve both deep and shallow relationships within the spider tree of life”
适用场景
- 蜘蛛系统发育关系研究: 解析蜘蛛目深层(如中突蛛亚目、原蛛亚目、新蛛亚目)及浅层(如属内种间)的进化关系。
- 分类学验证与修订: 基于高支持度的系统发育树,验证或修订蜘蛛科、属、种级别的分类体系。
- 宏观进化假说检验: 利用多尺度基因座数据,测试蜘蛛关键性状起源、生物地理扩散等宏观进化假说。
- 分子标记开发应用: 评估Spider Probe Kit在蜘蛛非模式生物中的通用性,为其他节肢动物类群的AHE研究提供参考。