数据集概述
本数据集基于spo11基因突变体的高通量测序数据,研究其重组特征变化。spo11是诱导减数分裂特异性双链断裂的拓扑异构酶样酶,数据集包含19个PCR诱导的SPO11等位基因突变体的遗传和细胞学特征分析,以及四分子测序揭示的基因转换片段长度变化等内容,共2个文件。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_PGENETICS_D_12_03065R3_ReCombine_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据分析说明,涉及测序平台(Illumina Genome Analyzer IIx)、图像分析流程(Illumina CASAVA_v1.8.0)、重组分析工具(ReCombine)、分析的四分子列表(WT、spo11_HI、spo11_LO等类型)及包含的文件夹说明(如countFiles)。
- 压缩数据文件
- 文件名称:PGENETICS_D_12_03065R3_ReCombine_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:为数据集的压缩包文件,包含与spo11基因突变体重组特征相关的测序数据及分析结果文件。
数据来源
论文“High throughput sequencing reveals alterations in the recombination signatures with diminishing spo11 activity”
适用场景
- spo11基因功能研究: 分析spo11活性降低对减数分裂重组、孢子活力及联会复合体形成的影响。
- 减数分裂重组机制研究: 探究基因转换片段长度与交叉(CO)关联的变化规律。
- 遗传分析方法优化: 解释spo11突变体原养型水平低的原因,为遗传研究中基因转换恢复偏倚的假设提供数据支持。
- 交叉稳态(CO homeostasis)研究: 验证DSB限制减数分裂中CO相对于NCO的维持机制。