数据集概述
本数据集为斑马鱼胚胎发育过程中TF-染色质关联与核体积变化的单分子成像研究数据，包含mEos2-TBP和mEos2-Sox19b两种转录因子的结合动力学、结合分数等定量信息，以及核体积数据，用于揭示合子基因组激活（ZGA）阶段转录因子与染色质相互作用的演化机制。
文件详解
- 文档类文件（.txt格式，共10个）
- 示例文件：README_for_SPT_TBP_ITM_events_ff.txt、README_for_SOX_nuclear_areas.txt等
- 内容：各数据文件的说明文档，包括数据采集与分析方案、软件使用指南等
- 科学数据文件（.mat格式，共9个）
- 示例文件：SOX_nuclear_areas.mat、SPT_Sox_ITM.mat等
- 内容：存储转录因子结合动力学（如ITM事件、停留时间）、核体积等定量实验数据
- 压缩包文件（.zip格式，共4个）
- 示例文件：Maple.zip、python_residence_time_fitting.zip等
- 内容：包含数据分析所需的Maple脚本、Python代码及相关资源
数据来源
Reisser et al的斑马鱼发育单分子成像研究
适用场景
- 发育生物学研究：分析斑马鱼胚胎ZGA阶段转录因子与染色质相互作用的动态变化
- 转录调控机制研究：探究核体积变化对TF-染色质结合的影响
- 生物信息学分析：利用结合动力学数据构建TF-染色质相互作用模型
- 分子成像技术应用：验证单分子追踪技术在活体胚胎研究中的有效性
- 数据驱动的发育模型构建：整合核体积与TF结合数据，建立发育过程的定量模型
